معده……………………………………….۵۸
۴-۸- بررسی ارتباط پلی مورفیسم rs 4072127 ژن GKN1 با خطر ابتلا به سرطان معده……………………………………….۵۸
۴-۹- بررسی ارتباط پلی مورفیسم‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های ژنGKN1 با نوع تومور………………………………………………………………………………..۶۰
فصل پنجم-بحث و نتیجه گیری
۵-۱- عوامل موثر در ابتلا به سرطان معده…………………………………………………………………………………………………………………۶۲
۵-۱-۱- بررسی نتایج حاصل از اثر عفونت هلیکوباکتر پیلوری بر ابتلا به سرطان معده………………………………………….۶۳
۵-۱-۲- بررسی نتایج حاصل از تاثیر الکل با خطر ابتلا به سرطان معده…………………………………………………………………۶۳
۵-۱-۳- سابقه سرطان در خانواده (اقوام درجه یک)……………………………………………………………………………………………….۶۴
۵-۱-۴- نتایج حاصل از بررسی ارتباط پلی مورفیسم‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های تک نوکلئوتیدی پروموتر ژن GKN1 با خطر ابتلا به سرطان
معده………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………۶۵
پیشنهادات………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………۶۷
رفرنس…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….۶۸
چکیده خارجی……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….۷۸
فهرست شکل ها
شکل ۱-۱-قسمت‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های مختلف معده……………………………………………………………………………………………………………………………..۴
شکل ۱- ۲- ترکیبات تشکیل دهنده موکوس……………………………………………………………………………………………………………..۱۲
شکل۱ - ۳- ساختار فضایی پروتئین های گاستروکین……………………………………………………………………………………………….۱۴
شکل ۱-۴- بیان GKNS، TFFS و موسین‌ها در اپیتلیوم معده موش………………………………………………………………………….۱۴
شکل ۱-۵- جایگاه ژنهای GKN1، GKN2 و GKN3 بر روی کروموزوم ۲ انسان…………………………………………………..۱۵
شکل ۱-۶- موقعیت ۳۸CYS در ۳ ژنGKN1، GKN2 و GKN3……………………………………………………………………………16
شکل ۳-۱: نمایی از تکنیک Tetra Primer ARMS- PCR……………………………………………………………………………………….36
شکل ۴-۱: الکتروفورز DNA استخراج شده بر روی ژل آگارز ۱ درصد. …………………………………………………………………..۵۱
شکل ۴-۲: تکثیر بخشی از ناحیه پروموتری ژن GKN1 (GKN1A)……………………………………………………………………..52
شکل ۴-۳: تکثیر بخشی از ناحیه پروموتری ژن GKN1 (GKN1B)………………………………………………………………………..53
شکل ۴-۴ : مقایسه توالی ناحیه پروموتر ژن GKN1 با نرم افزار SeqMan ………………………………………………………………54
شکل ۴-۵: ژنوتیپ‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های مختلف در SNP rs 4557760 در پروموتر ژن GKN1………………………………………………………..54
شکل۴-۶ :ژنوتیپ‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های مختلف در SNP 72127 rs 40 در پروموتر ژن GKN1 ……………………………………………………….55
شکل۴-۷: تعیین ژنوتیپ SNP با شناسه ۴۵۵۷۷۶۰ rs ژن GKN1 با تکنیک Tetra Primer ARMS- PCR………..56
شکل۴- ۸: تعیین ژنوتیپ SNP با شناسه ۴۰۷۲۱۲۷ rsژن GKN1 با تکنیک .Tetra Primer ARMS- PCR………57
شکل ۵-۱: نواحی پروموتری ژنهای GKN2، TFF1، TFF2 و TFF3 و فاکتورهای رونویسی مربوط به این ژن‌ها….۶۷
فهرست جداول
جدول ۱-۱- خلاصه ای از پلی مورفیسم‌ها‌یی که با انواع منتشر و روده ای سرطان معده در ارتباط هستند……………۱۹
جدول ۳-۱- توالی پرایمرهای GKN1A و GKN1B…………………………………………………………………………………………………….32
جدول ۳-۲- شرایط PCR جهت تکثیر ناحیه پروموتری ژن GKN1 (GKN1A و GKN1B )…………………………………..33
جدول ۳-۳- میزان مواد مورد نیاز PCR جهت تکثیر ناحیه پروموتری ژن GKN1…………………………………………………….34
جدول ۳-۵- توالی پرایمرهای مورد استفاده در Tetra- primer ARMS PCR برای تعیین ژنوتیپ rs4575760……..37
(( اینجا فقط تکه ای از متن درج شده است. برای خرید متن کامل فایل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت nefo.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. ))
جدول ۳-۶- توالی پرایمرهای مورد استفاده در Tetra- primer ARMS PCR برای تعیین ژنوتیپ rs4072127……..38
جدول ۳-۷- مواد و حجم مورد نیاز برای انجام Tetra- primer ARMS PCR برای تعیین ژنوتیپrs 4575760 ……39 جدول ۳-۸- مواد و حجم مورد نیاز برای انجام Tetra- primer ARMS PCR برای تعیین ژنوتیپ rs 4072127 ….40 جدول۳-۹- شرایط PCR برای تعیین ژنوتیپ rs4575760…………………………….. …………………………..41 جدول۳-۱۰- شرایط PCR برای تعیین ژنوتیپ rs4072127………………………………………………………………………………………41 جدول۴-۱: مشخصات نمونههای جمعیت A……………………………………………………………………………………………………………….45
جدول۴-۲: مشخصات نمونههای جمعیت B……………………………………………………………………………………………………………….46
جدول ۴-۳: ژنوتیپ نمونههای بیمار و شاهد پلی‌مورفیسم rs 4557760 ………………………………………………………………….59
جدول ۴-۴: ژنوتیپ نمونههای بیمار و شاهد پلی مورفیسم rs 4072127 ………………………………………………………………..59
فهرست نمودارها
نمودار۴-۱- فراوانی سرطان های Intestinal (19 نفر)و diffuse (12 نفر) در بیماران آلوده به هلیکوباکتر پیلوری در
جمعیت A……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..47
نمودار ۴-۲- فراوانی سرطان های Intestinal (17 نفر) و diffuse (11 نفر) در مبتلایان به هلیکوباکتر پیلوریدر
جمعیت B…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….48
نمودار۴-۳: فراوانی افراد الکلی و غیر الکلی در گروه بیمار و شاهد در جمعیت A……………………………………………………49
نمودار ۴-۴: فراوانی افراد الکلی و غیر الکلی در گروه بیمار و شاهد در جمعیتB ………………………………………………….49
نمودار ۴-۵: فراوانی ازدواج فامیلی و غیر فامیلی والدین در گروه بیمار و شاهد جمعیت A……………………………………50
نمودار ۴-۶: فراوانی ازدواج فامیلی و غیر فامیلی والدین در گروه بیمار و شاهد جمعیت B…………………………………..50
